Illumina Miseq是2011年2月推出的新一代小型化（bench-top）測序儀，這款儀器使用了Illumina TruSeq可逆中止堿基邊合成邊測序的化學方法，與HiSeq 2000相比，雖然每個Run的測序通量很低，但是久經(jīng)考驗的新一代測序試劑帶來無可比擬的準確性，結(jié)合上全新的流體系統(tǒng)，使得一個測序循環(huán)時間縮短了8倍以上。

技術(shù)特點

1、測序周期短：Miseq V2 150PE運行時間短至24小時，可用于快速1的擴增子測序或小基因組測序，以極少的時間完成數(shù)據(jù)量需求較少的項目。

2、Pair-end 讀長達250bp：Miseq測序讀長已經(jīng)達到2×250bp，可有效地跨越復雜基因組的高度重復區(qū)域，從而提高拼裝的效果，更有利于進行基因注釋和基因功能的深入挖掘。

3、測序流程便捷：小巧、一體化的MiSeq平臺整合了cluster生成，Pair-end測序和完整的數(shù)據(jù)分析，節(jié)省了實驗室空間。通過直觀的觸摸屏界面開展簡單的儀器操作，即插即用的試劑帶有RFID追蹤，具有自動化的便利。

測序流程

應用范圍

1、擴增子測序

長的末端配對讀取能力、速度與高數(shù)據(jù)質(zhì)量，使得擴增子測序的項目可在幾天內(nèi)完成。

2、轉(zhuǎn)錄組測序

與454測序儀相比，長度類似，價格便宜，便于實現(xiàn)De novo組裝，更的基因注釋。

3、小基因組De novo組裝

2×250bp讀長與高達7G的測序通量，適合如微生物這類小基因組的項目，拼接效果好。

4、微生物多樣性分析

2×250bp讀長，已經(jīng)可以測通一些可變區(qū)域，更有利于提高分析結(jié)果的準確性。