后歷任三司戶部判官，出京任京東轉(zhuǎn)運(yùn)使，改尚書工部員外郎、直集賢院，調(diào)任陜西，又調(diào)任河北，入朝任三司戶部副使。廬州是包拯的家鄉(xiāng)，任知州時，他的親朋故舊多以為可得其庇護(hù)，干了不少仗勢欺人，甚至擾亂官府的不法之事。秦隴斜谷務(wù)所的造船木材，一概向百姓征收索??；又七個州交納河橋竹索的賦稅，一般有幾十萬，包拯都奏請加以廢除。契丹在鄰近邊塞地區(qū)集結(jié)，邊境州郡漸加戒備，命令包拯去河北調(diào)發(fā)軍糧。包拯說：“漳河地區(qū)肥沃的土壤，百姓不能耕種，邢、沼、趙三州農(nóng)田一萬五千頃，一概用來牧馬，請求把這些全都分給百姓?！甭爮乃囊庖?。解州鹽法規(guī)定使百姓困竭，包拯前去加以經(jīng)營管理，請求一概與商販流通交換。              

除任龍圖閣直學(xué)士、河北都轉(zhuǎn)運(yùn)使。包拯命令制造的硯臺僅僅滿足貢數(shù)，他在任滿一年沒拿一方硯臺回家。曾經(jīng)提議太平無事時把調(diào)到內(nèi)地，沒有答復(fù)。至此時，請求：“解除河北駐守，把他們分布在黃河以南的兗、鄲、齊、濮、曹、濟(jì)各郡，如果有緊急情況，沒有誤時的憂慮。如果說駐守不能立刻削減，請求訓(xùn)練民兵，稍加供給干糧，每年的費(fèi)用，不到駐守一個月的開支，一個州的賦稅，那么供給的人數(shù)就多了。”沒有答復(fù)。調(diào)任知瀛州，各州用官府的錢做買賣，年累計虧負(fù)十多萬，都上奏加以除去。因喪子請求任政務(wù)清簡的郡職，知揚(yáng)州，調(diào)任到廬州，遷升刑部郎中。除龍圖閣直學(xué)士、河北都轉(zhuǎn)運(yùn)使。

不必要的費(fèi)用，按條文督促各路監(jiān)司盡忠職守，御史府可以自己舉薦所屬官員，減少官吏一年的休假日期，這些建議都得以施行。溘然長逝嘉祐七年（1062）五月，包拯在樞密院視事時，突然得病，數(shù)日后，旋即因患病逝世，終年六十四歲。蹊田奪牛張方平任三司使時，由于買土豪的財產(chǎn)，包拯上章將其彈劾免官；宋祁接替了張方平，包拯又彈劾他；宋祁被免后，就由包拯以樞密直學(xué)士暫代三司使。對此歐陽修說：“包拯是所謂牽牛踩踏了田而奪了人家的牛（蹊田奪牛），處罰已經(jīng)很重了，可他又貪圖肥缺來做那個職務(wù)，不也是過分了嗎？”包拯因此待在家里，以躲避代理三司的命令，過了很久才出來任職。

嘉祐六年（1061年），升任給事中，任三司使。幾天以后，拜樞密副使。不久，調(diào)任禮部侍郎，但他推辭不受。溘然長逝嘉祐七年（1062）五月，包拯在樞密院視事時，突然得病，數(shù)日后，旋即因患病逝世，終年六十四歲。獲贈禮部尚書，謚號孝肅。