另一點(diǎn)需要注意的是回灌對(duì)熱儲(chǔ)水質(zhì)的影響。無(wú)論是利用換熱后的地?zé)嵛菜€是地表水系進(jìn)行回灌，溫度與地層水溫是不同的，由于溫度的變化，物理性質(zhì)可能發(fā)生變化。當(dāng)回灌入熱儲(chǔ)層，與地?zé)崃黧w混合，就有可能造成熱流體化學(xué)組分變化，導(dǎo)致熱儲(chǔ)層水質(zhì)的變化。

一般基巖回灌是嚴(yán)格的全封閉式原水回灌，即地?zé)崴?jīng)抽水并提取經(jīng)熱交換器換熱后，直接灌入回灌井中。地?zé)崴谕耆忾]系統(tǒng)中運(yùn)行，水質(zhì)基本不受到污染。根據(jù)幾年水質(zhì)統(tǒng)測(cè)的結(jié)果分析，回灌前后地?zé)峋髦饕x子活度逐年變化不大，說(shuō)明回灌后對(duì)原熱儲(chǔ)層水化學(xué)組分沒(méi)有造成質(zhì)的變化。

選擇合適的回灌方式是重要的。從平面布置上講，回灌井的布置有“混雜排列”和“邊對(duì)邊排列”兩種。前者是生產(chǎn)井和回灌井穿插排列，保持一定的距離；后者是生產(chǎn)井在一邊，回灌井在另一邊，中間有較遠(yuǎn)的距離。對(duì)這兩種排列方式的優(yōu)劣，專家們看法不一。有的專家支持邊對(duì)邊回灌方式，認(rèn)為這種方式對(duì)裂隙熱儲(chǔ)層合適。熱儲(chǔ)層熱導(dǎo)率大，水流速度快(已觀測(cè)到示蹤劑重現(xiàn)速度達(dá)100m/h)，生產(chǎn)井若離回灌井近，就會(huì)發(fā)生熱干擾。但像巴黎盆地那種孔隙型熱儲(chǔ)層，生產(chǎn)井和回灌井成為對(duì)井，距離約為1km，計(jì)算表明，生產(chǎn)井溫度可以保持30年，以后逐漸降低。溫度下降是緩慢的，可能要5年才下降1~2℃。這些，都和熱儲(chǔ)有關(guān)。回灌井深度的選擇也很重要，它可以比生產(chǎn)井淺、相同或深。在美國(guó)蓋塞爾斯地?zé)崽?，回灌井一度曾較淺，結(jié)果回灌進(jìn)去的水又重新被開采出來(lái)；后來(lái)采用深層回灌，就沒(méi)有發(fā)生上述情況。這可能是溫度較低的回灌比重大，容易向下運(yùn)移的原因。回灌井淺，灌入的水向下流動(dòng)正好進(jìn)入生產(chǎn)井；反之，就不會(huì)影響生產(chǎn)井?？傊?，回灌方式的選擇取決于地質(zhì)、環(huán)境和經(jīng)濟(jì)等綜合因素；但一般地說(shuō)，邊對(duì)邊的、深一些的回灌井布局能避免熱干擾。

由于地下水具有一定的壓力、受透水層阻力影響，抽取容易，回灌慢。地下水含礦物質(zhì)，微生物，在抽取回灌過(guò)程，由于管井并非密閉加壓回灌方式，水在從地下抽取過(guò)程中，含氧量也發(fā)生了變化，經(jīng)物理反應(yīng)，產(chǎn)生氣泡含發(fā)黏的膠狀物，由井內(nèi)向地層滲透時(shí)粘結(jié)堵塞了慮水管間隙，透水率降低，就出現(xiàn)回灌不下去的現(xiàn)象。其原因主要是回灌井結(jié)構(gòu)及成井工藝問(wèn)題：抽水時(shí)地下水從地下含水層經(jīng)礫料、慮水管進(jìn)入井內(nèi)被抽出。濾料、濾水管起到很好的過(guò)濾作用。而回灌時(shí)水從井管內(nèi)經(jīng)濾水管、礫料向地層滲透，如果回灌井還按照抽水井結(jié)構(gòu)及成井工藝，回灌井中膠狀發(fā)黏物，被過(guò)濾粘結(jié)堵塞了透水間隙。所以原來(lái)普遍使用的給水井抽水井結(jié)構(gòu)，不適應(yīng)作為回灌井。另外片面強(qiáng)調(diào)水井抽取量，而過(guò)量開采，動(dòng)水位(降深值)增大，粉細(xì)紗抽入井內(nèi)或堆積水井周圍抽取的水中含砂量超標(biāo)，影響降低透水率，所以在第四系地層取水，必須按照當(dāng)?shù)厮牡刭|(zhì)條件。水位降深值(動(dòng)水位)不超過(guò)15米，含砂量少于1/20萬(wàn)，否則影響水井使用壽命，逐年降低出水量，嚴(yán)重者造成地面下沉，附近建筑物受到影響。