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普利萊-植物RNA快速提取試劑盒-貨號-R1052-50
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普利萊 植物RNA快速提取試劑盒 貨號: R1052-50
貨號 | 產(chǎn)品名稱 | 規(guī)格 | 價格 |
R1052-50 | 植物RNA快速提取試劑盒 | 50次 | 400元 |
R1052-100 | 植物RNA快速提取試劑盒 | 100次 | 680元 |
描述:Plant RNAtrip是一種單相RNA快速提取試劑盒,可高效裂解堅固的植物細胞并強烈抑制RNA酶活性。細胞破碎之后,植物多糖立即被Plant RNAtrip獨特的成分結(jié)合。離心抽提步驟將RNA與滅活的RNA酶、蛋白、基因組DNA污染分離,并清除植物多糖多酚以及次生代謝產(chǎn)物。在RNA沉淀之前加入Plant RNA Aid清除植物多酚,并清除殘余的多糖。提取可在60分鐘內(nèi)完成,所提取的RNA純度極高,不含DNA和多糖和多酚污染,可用于構(gòu)建cDNA文庫、RT-PCR、Northern轉(zhuǎn)印分析、Poly(A) mRNA純化、體外翻譯、和RNA酶保護實驗。適于各種植物組織RNA提取,也特別適合富含糖原的動物肝臟和肌肉組織提取高純度RNA。如果植物組織富含多酚和次生代謝產(chǎn)物,推薦使用Plant RNA Extraction kit (R1050)。
組成 (100次提取):
(1) Plant RNAtrip: 100 ml,用于植物組織裂解、分離RNA、結(jié)合植物多糖和多酚;
(2) Plant RNA Aid: 5 ml, 用于進一步去除植物多酚和多糖和次級代謝產(chǎn)物。
適用范圍:
適用于各種植物組織。每1 ml Plant RNAtrip試劑可裂解200 mg新鮮或凍存植物組織或5-10 ′ 106個培養(yǎng)細胞。也特別適用于富含糖原的動物肝臟肌肉組織。
儲存條件: 4°C密封避光保存
效期:1年
用戶實驗用品和操作準(zhǔn)備:
極微量的RNA酶都會導(dǎo)致RNA降解。分離RNA時RNA酶污染主要來自以下五個方面:(1) 實驗人員的雙手。(2) 器皿、吸頭離心管、自備液體。(3) 組織細胞破碎不可避免地釋放內(nèi)源RNA酶。(4) RNA未能完全與蛋白質(zhì)分離。(5) RNA沉淀和溶解時來自吸頭離心管和溶液。我們的Step by Step質(zhì)量監(jiān)測表明,Plant RNAtrip可強烈抑制RNA酶活性并在分離步驟清除RNA酶。因此在有Plant RNAtrip存在的步驟,使用高壓消毒20分鐘的吸頭離心管和溶液即可勝任RNA提取操作。然而在RNA溶解之后,來自實驗材料的RNA酶污染將會導(dǎo)致RNA降解,因此應(yīng)嚴(yán)格使用高壓滅活RNA酶的用品。戴手套無疑是有益的。只要嚴(yán)格按照本指南進行準(zhǔn)備和操作,使用Plant RNAtrip總是能獲得高純度RNA。
1. 固體組織破碎設(shè)備??捎孟铝醒b置之一:1)玻璃勻漿器。泡酸清潔,用高壓滅菌蒸餾水洗滌數(shù)次。2)研缽。適用于液氮凍存組織的研磨,清洗方法同玻璃勻漿器。3)高速機械勻漿器(Polytron,Tekmar或類似產(chǎn)品),打開開關(guān),在蒸餾水中清洗分散器頭數(shù)次。
2. 高壓蒸汽30分鐘消毒一次性吸頭離心管。RNA沉淀溶解之后,應(yīng)嚴(yán)格使用高壓消毒的一次性用品。然而Plant RNAtrip能在RNA酶污染環(huán)境下工作,在裂解步驟可使用未高壓但潔凈的一次性吸頭和離心管,但僅推薦在緊急情況下這樣做。
3. 普通雙蒸水,高壓消毒20分鐘。用于沖洗器皿,配制瓊脂糖凝膠和電泳用緩沖液。DEPC處理的雙蒸水。加DEPC到水中至終濃度為0.01% v/v,室溫過夜,高壓消毒30分鐘。用于溶解RNA,配制TE緩沖液和75%乙醇。
4. 濕冰。在冰上進行操作有助于減少RNA降解。
5. 其它用品。電泳槽,雙蒸水沖洗。離心機和加樣器,無需處理。
6. 戴手套。注意某些實驗如提取質(zhì)粒DNA如使用極大量RNA酶,為防污染,須全面仔細清洗實驗器具和實驗區(qū)域。
RNA提取程序:
1. 植物組織細胞破碎與裂解
冰上操作。立即并快速破碎組織至關(guān)重要。初始組織細胞過量不僅使RNA得率下降,還將導(dǎo)致DNA和蛋白質(zhì)污染。
1.1.植物組織破碎與裂解
確定組織用量:推薦按比例每50-200 mg新鮮植物組織加1 ml Plant RNAtrip,但植物組織用量的上限變化甚大。(1)某些新鮮植物組織含水量甚高,而較干燥的植物組織50mg可能已經(jīng)接近上限。為獲足量RNA必須測試加入每種組織的量。注意使用過量的組織將導(dǎo)致提取失敗。 (2) 軟組織、葉片、花、多汁組織、發(fā)芽種子等可直接加入Plant RNA Reagent研磨破碎,而堅硬的植物組織如種子、木質(zhì)莖干等最好先在液氮中研磨破碎為粉末。
按比例每50-200 mg植物組織加1 ml Plant RNAtrip,按下列方法之一裂解組織。(1) 研缽:適用于液氮凍存組織。將液氮凍存組織研成粉末,加1 ml Plant RNAtrip,繼續(xù)研磨組織至完全破碎也可轉(zhuǎn)移到玻璃勻漿器繼續(xù)研磨。(2) 玻璃勻漿器:放入剪碎的新鮮植物組織,加入1 ml Plant RNAtrip,放置冰上,上下手動勻漿組織10-20次。(3) 內(nèi)切式高速機械勻漿器:將植物組織放入塑料或玻璃試管內(nèi),試管置冰浴燒杯中,加入1 ml Plant RNAtrip,將內(nèi)切式分散器頭插入管內(nèi)溶液中間并與組織塊接觸,轉(zhuǎn)速12,000-20,000 rpm,緩慢上下移動試管10-20次,直到大部分組織打散。注意:少量難以打碎的組織碎片不影響后續(xù)RNA提取。用研缽和玻璃勻漿器勻漿組織時應(yīng)略微多加一些裂解液以補充裂解產(chǎn)物粘在器皿壁上造成的體積丟失。破碎組織用玻璃勻漿器可能比液氮研磨方便。
1.2.植物培養(yǎng)細胞的破碎與裂解
棄培養(yǎng)基,收集細胞。每5-10 ′ 106個細胞加1 ml Plant RNAtrip,須有效地覆蓋瓶皿的細胞表面。晃動或用吸頭吹打使提取液流過并裂解所有細胞。置冰上10分鐘,傾斜瓶皿使粘稠的裂解物聚于一處以便取出。
2 將裂解產(chǎn)物轉(zhuǎn)移到1.5 ml離心管,置冰上20分鐘。注意:富含多糖和多酚的植物組織可延長孵育時間至30-60分鐘。
3 12,000 ′ g 4°C 離心10分鐘。取離心后的上清液,轉(zhuǎn)移到新管。注意:組織纖維碎片、植物多糖、多酚沉淀在管底。大部分基因組DNA也在管底形成疏松粘稠的團狀物。取上清液時如吸入少量拉絲狀DNA粘稠物,不影響后續(xù)實驗。
4 加入0.2 ml氯仿,充分顛倒混勻,冰上孵育5分鐘。
5 12,000 ′ g,4°C離心10分鐘,溶液分為兩相。RNA在上層水相,下層為有機相,兩相界面為一層薄膜。吸出0.5 ml上層水相轉(zhuǎn)移到新離心管。注意:取上清液時應(yīng)保留0.5-1 mm厚的水相,以免擾動和吸入下面的碎片和有機相。如果吸入,應(yīng)將所取的上清液放回管中并重新離心10分鐘,再次吸取水相。這一點至關(guān)重要,違背此原則容易導(dǎo)致RNA降解和DNA污染。
6 加入上清液1/10體積(~50ml) 的Plant RNA Aid到上清液,混勻,冰上孵育15分鐘以進一步結(jié)合植物多酚和多糖,溶液將會變渾濁。離心12,000 ′ g 4°C 10分鐘。小心吸出上層水相轉(zhuǎn)移到新離心管,勿擾動和吸入下面的透明膠凍狀多酚和多糖沉淀。注意:完全去除植物多糖至關(guān)重要,否則將明顯降低RNA回收率,并使沉淀呈難溶解的膠凍狀。
7 將步驟5或6獲得的上清約500-600ml轉(zhuǎn)移到新管,加入等體積異丙醇,混勻。冰育5-10分鐘已足以沉淀RNA。用更低的溫度和更長的時間進行沉淀僅在組織極少時有用。
8 10,000 ′ g,4°C 離心10分鐘。管底可見少許RNA沉淀。注意:如初始組織細胞量少,RNA將附著在管壁,用肉眼幾乎難辨沉淀,但不影響實驗。如RNA 沉淀量很多并呈膠凍狀,通常表明有多糖、多酚和蛋白污染。應(yīng)仔細檢查操作步驟。一個補救措施是用Plant RNAtrip溶解沉淀,從步驟2開始重新抽提沉淀。
9 棄上清。立即加入1 ml 75%乙醇,顛倒混勻數(shù)次洗滌沉淀。12,000 ′ g離心5分鐘。棄上清,盡量完全吸去管壁上的液體。注意:乙醇洗滌后RNA沉淀容易漂浮,勿倒掉或吸走RNA沉淀。RNA沉淀在75%乙醇中可在4°C保存一周或在-20°C保存一年。
10 敞開管口空氣干燥5-10分鐘使殘留液體揮發(fā),RNA略微沉淀干燥即可。用50-100 ml自備的DEPC處理的高壓消毒純水溶解沉淀。RNA溶液可保存于-70°C或液氮中。注意:過分干燥將使RNA難以溶解。55°C加熱或反復(fù)凍融數(shù)次可以助溶。RNA溶液加3倍體積乙醇凍存于-20°C,用時離心沉淀。
說明
1.測定OD值,根據(jù)OD260計算RNA濃度。OD260/280比值可初步判斷RNA質(zhì)量,比值在1.6-2.0之間均屬正常。起始組織量過大,或吸取了有機相或碎片,將使RNA樣品中蛋白和雜質(zhì)含量高,RNA沉淀乙醇洗滌不充分(步驟8),均可導(dǎo)致OD260/280比值降低。但切記OD260/280比值還受很多非質(zhì)量因素的影響。例如,RNA用水溶解或pH偏酸OD260/280偏低,用TE或離子強度較高的溶液溶解時較高,但均不影響RNA后續(xù)使用。切記即便是已降解的RNA,OD260/280比值也能達到看似完美的2.0左右,因此該比值并非判斷RNA降解與否最佳的指標(biāo)。判斷RNA質(zhì)量的最佳途徑是進行普通RNA瓊脂糖電泳檢查RNA完整性。
2. 檢查RNA完整性。取1 mg RNA樣品,加5ml 純水加1ml上樣緩沖液進行1%普通瓊脂糖凝膠電泳。溴化乙錠染色,紫外燈觀察。
3. 檢查RNA完整性。取1 mg RNA樣品,加5ml 純水加1ml上樣緩沖液,進行1%普通瓊脂糖凝膠電泳。溴化乙錠染色,紫外燈觀察。
4. Plant RNAtrip試劑勿直接接觸皮膚和吸入。如接觸皮膚,立即用大量水清洗。
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