中成藥加工需用大量水，由于中成藥加工過程中，及洗滌過程中，會產生植物質酸，及大量植物質纖維。由于生產過程中需添加大量糖分。所以水質可生化性較好，清洗過程中會帶出部分植物殘渣。水質具有高COD，高懸浮物適合生化等特點。