雨花石的成分是以二氧化硅為主，其中紅色成分為鐵離子和亞鐵離子。雨花石是石質(zhì)為瑪瑙、蛋白石、玉髓、石英等的卵石，見于河床、河流階地的沉積物之中。雨花石是由石英、玉髓和燧石或蛋白石混合形成的珍貴寶石，也稱雨花瑪瑙。雨花石的孕育到形成，經(jīng)過了原生形成、次生搬運(yùn)和沉積礫石層這三個復(fù)雜而漫長的階段，也可謂是歷盡滄桑方顯風(fēng)流了。雨花石又分為細(xì)石和粗石兩類，細(xì)石以瑪瑙為主，石質(zhì)細(xì)膩，顏色艷麗，磨圓度高，晶瑩可愛；粗石質(zhì)地較粗，以石英或變質(zhì)巖為主，價值較低。

雨花石的圈狀花紋是二氧化硅膠液圍繞火山巖空隙、空腔，由內(nèi)壁開始，從外向內(nèi)多層次逐層沉淀而成。在其生長過程中，常常發(fā)生帶色離子和化合物的周期擴(kuò)散。原生瑪瑙的主要化學(xué)成分是二氧化硅，其次是少量的氧化鐵和微量的錳、銅、鋁、鎂等元素及化合物。

由于雨花石種類繁多，它的成因和化學(xué)成分極為復(fù)雜。以瑪瑙礫石為例，它來源于原生瑪瑙。一般認(rèn)為，原生瑪瑙是由巖漿的殘余熱液形成的。