生物有機肥養(yǎng)分含量高;精制有機肥由于高溫處理，造成了養(yǎng)分損失。生物有機肥經(jīng)除臭，氣味輕，幾乎無臭;精制有機肥未經(jīng)除臭，返潮即出現(xiàn)惡臭。生物有機肥腐熟，蟲卵死亡率達到95以上;農(nóng)家肥堆放簡單，蟲卵死亡率低。生物有機肥無臭;農(nóng)家肥有惡臭。生物有機肥施用方便，均勻;農(nóng)家肥施用不方便，肥料施用不均勻。生物有機肥價格便宜，每噸在1000多元左右;生物菌肥價格昂貴，每噸上萬元。

不斷更新土壤有機質(zhì)。有機肥料轉(zhuǎn)化為土壤有機質(zhì)約占土壤有機質(zhì)年形成量的三分之二，可見要補充有機肥料才能不斷更新土壤有機質(zhì)。很顯然，施用有機肥料提高土壤肥力非常重要。 生物有機肥是指特定功能微生物與主要以動植物殘體(如畜禽糞便、農(nóng)作物秸稈等)為來源并經(jīng)無害化處理、腐熟的有機物料復(fù)合而成的一類兼具微生物肥料和有機肥效應(yīng)的肥料。