游離氯可以氧化破壞反滲透膜，反滲透一般要求進水余氯<0.1ppm;有機物不僅是微生物的餌料，而且當其濃縮到一定程度后，可以溶解有機膜材料，使膜性能劣化。水中有機物種類繁多，不同的有機物對反滲透膜的危害也不一樣，因而在反滲透預處理系統(tǒng)設計時，如果水中總有機碳(TOC)的含量超過2mg/L，一般需要進行處理，對于以自來水為水源的凈化系統(tǒng)，活性炭吸附是必要的，因為地表水中有機物含量較高。生物污染是指微生物在膜-水界面上積累從而影響系統(tǒng)性能的現象。微生物污染是膜材料、流動參數（如溶解物，流動速度，壓力等）和微生物間復雜的相互作用的結果。微生物污染基本上是一個生物膜生長的問題。