選擇合適的回灌方式是重要的。從平面布置上講，回灌井的布置有“混雜排列”和“邊對邊排列”兩種。前者是生產(chǎn)井和回灌井穿插排列，保持一定的距離；后者是生產(chǎn)井在一邊，回灌井在另一邊，中間有較遠的距離。對這兩種排列方式的優(yōu)劣，專家們看法不一。有的專家支持邊對邊回灌方式，認為這種方式對裂隙熱儲層合適。熱儲層熱導(dǎo)率大，水流速度快(已觀測到示蹤劑重現(xiàn)速度達100m/h)，生產(chǎn)井若離回灌井近，就會發(fā)生熱干擾。但像巴黎盆地那種孔隙型熱儲層，生產(chǎn)井和回灌井成為對井，距離約為1km，計算表明，生產(chǎn)井溫度可以保持30年，以后逐漸降低。溫度下降是緩慢的，可能要5年才下降1~2℃。這些，都和熱儲有關(guān)。回灌井深度的選擇也很重要，它可以比生產(chǎn)井淺、相同或深。

根據(jù)前面分析可能出現(xiàn)的問題，地面工程設(shè)計應(yīng)在保證供熱前提下，重點解決物理堵塞和氣體堵塞。

為了保證回灌順利，在回灌井口設(shè)置合適的過濾器非常重要。

  在選擇精過濾濾料精度時應(yīng)根據(jù)實際情況采用3-5μm標準。過濾量根據(jù)實際回灌量決定。由于過濾精度高，不僅過濾效果好，還可以將部分微生物濾掉，有效防止井內(nèi)回灌時物理堵塞。

回灌在地?zé)峁こ讨胁粌H僅是需要處理利用后廢棄的低溫水，更主要的是保護環(huán)境，位置熱儲壓力，以及加快從熱巖中提取熱量達到可循環(huán)利用的目的。但是，如果采用回灌方法和技術(shù)不當(dāng)，也可能會對地?zé)峋偷貙訖C構(gòu)造成不同程度的損害，如果在遇到由細小物質(zhì)結(jié)合面生成的斷裂型沉積巖時，有可能發(fā)生這種損害。在20世紀80年代初，在巴黎三疊紀巖層的幾眼回灌井中，物理顆粒的侵入和氣泡堵塞等對井下構(gòu)造通道的損害已受到了人們廣泛關(guān)注。