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調(diào)制好的培養(yǎng)料必須立即進房，進房前可在床上鋪一層用0.1%高，或3%，或0.25%新潔爾滅浸洗過的薄膜。進料先鋪上層床，再鋪下層床，每層厚10~15厘米，天暖薄些，天冷厚些。一般每平方米用料17.5~20公斤。床面必須平整，中部稍高，成龜背形，以利排水。選無霉變的稻草，切成6~10厘米長（也有不切的），用0.5%石灰水浸泡12小時（有條件的用沸水浸或蒸汽加熱處理更好），然后用清水沖淋（不用石灰水泡的不用沖），直至其中淋下的水的pH7.5左右為止。




這樣，既可滿足菌絲生長需要較高的溫度，子實體分化需要略低的溫度，又可進行各種菇的交又培養(yǎng)，不浪費時間和空間。地下栽培室多的單位，可采取輪換使用(間歇使用)，以減少雜菌污染。選用少孢或無孢射的菌株，減少人防工程內(nèi)孢子的密度。在食(藥)用菌生產(chǎn)中，深層發(fā)技術除了可以生產(chǎn)液體以外，還可以生產(chǎn)菌絲體產(chǎn)品，包括從食(藥)用菌菌絲體和發(fā)酵液中提取多糖。許多大型真菌的菌絲體中含有豐富的營養(yǎng)物質(zhì)，如菌體蛋白或某種特殊的食療成分。因此可以將培養(yǎng)的菌絲體加工為人類食品或用作食品的配料，或添加在禽飼料中以增加飼料的營養(yǎng)價值。

利用深層發(fā)酵技術可使某些食用菌產(chǎn)品生產(chǎn)工廠化，特別是對于某些難于在人工培養(yǎng)基上產(chǎn)實體或者其菌絲體具有與子實體相類似的食(藥)用菌，例如靈芝( Ganoderma lucidum)、羊肚菌( Morchella esculenta)、蜜環(huán)菌( Armillaria mellea)、( Cod yepes sinensis)等，則可利用發(fā)酵產(chǎn)物作為代用品，部分代替子實體的食(藥)用價值。

人防工事栽培方式的改革，生料或熟料栽培食用菌，應采用封閉式袋裝。采用兩步栽培法，地下栽培室多的單位，可以采用輪換的方式。還要減少人防工事的孢子密度。深層發(fā)酵技術除可以生產(chǎn)液體，還能生產(chǎn)菌絲體產(chǎn)品。菌絲中含有豐富的營養(yǎng)物質(zhì)，可以將菌絲加工成食品或食品的配料。