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原位雜交是指；分子雜交的一種形式。由未經(jīng)抽提分離的染色體DNA，在原來位置上被變性成單鏈后，與探針進(jìn)行分子雜交。1977年由本頓(W.D.Benton)和戴維斯(R.W.Davis)在原分子雜交基礎(chǔ)上發(fā)展的一種較新的分子雜交技術(shù)。方法是將菌落或噬菌斑轉(zhuǎn)移到硝9酸纖維素濾膜上，使在原位發(fā)生溶菌后變性的DNA，同濾膜原位結(jié)合，再與有放5射性同位素標(biāo)記的特定核苷酸“探針”雜交，其結(jié)果可用放5射自顯影來顯示，出現(xiàn)銀粒的地方便是待測染色體DNA上與探針互補(bǔ)順序所在的位置。對快速檢測轉(zhuǎn)化群落中的DNA序列或任何一種插入的DNA序列，以及動植物的基因定位工作，都具有廣泛應(yīng)用價值。(見“分子雜交”、“放5射自顯影”、“影印培養(yǎng)技術(shù)”)

就DNA探針和RNA探針的比較，DNA探針在雜交過程中會出現(xiàn)探針雙鏈之間退火的可能，也更傾向于在溶液中形成大分子的探針聚合體，從而影響其滲透能力。而RNA 探針的應(yīng)用，將提高DNA-RNA雜交子的熱穩(wěn)定性。

Tips：RNA探針因其單鏈、高分子結(jié)合力、可適應(yīng)高溫雜交的特性，其檢測特異性和靈敏度均優(yōu)于DNA探針。常用的RNA探針標(biāo)記方法為構(gòu)建質(zhì)粒后進(jìn)行轉(zhuǎn)率合成。通過PCR擴(kuò)增的方法，可以更方便地進(jìn)行RNA探針的制備；RNA探針合成后，還需驗證其對目標(biāo)片段檢測的靈敏度和特異性。

原位雜交組織（或細(xì)胞）化學(xué)技術(shù)簡稱原位雜交（In situ hybridization, ISH）是應(yīng)用已知堿基順序并帶有標(biāo)記物的核酸探針與組織細(xì)胞內(nèi)待測的核酸，按堿基互補(bǔ)配對原則進(jìn)行特異性結(jié)合，形成雜交體，然后用與標(biāo)記物相應(yīng)的檢測系統(tǒng)，通過組織化學(xué)或免3疫組織化學(xué)方法在核酸原有位置進(jìn)行細(xì)胞內(nèi)定位、定性和定量研究。為分子水平研究細(xì)胞內(nèi)基因表達(dá)及有關(guān)細(xì)胞5因子的調(diào)控提供了有效的工具?？梢暈榻M織化學(xué)與免3疫組織化學(xué)的重大突破。

原位雜交不需要從組織中提取核酸，對于組織中含量極低的靶序列有極高的敏感性，并可完整地保護(hù)組織和細(xì)胞的形態(tài)，更能準(zhǔn)確地反映出組織細(xì)胞的相互關(guān)系及功能狀態(tài)。