百日菊一年生草本。莖直立，高30-100厘米，被糙毛或長硬毛。葉寬卵圓形或長圓狀橢圓形，兩面粗糙，下面被密的短糙毛，基出三脈。頭狀花序單生枝端，總苞寬鐘狀；總苞片多層，寬卵形或卵狀橢圓形。舌狀花深紅色、玫瑰色、紫堇色或白色，舌片倒卵圓形，先端2-3齒裂或全緣，上面被短毛，下面被長柔毛。管狀花黃色或橙色，先端裂片卵狀披針形，上面被黃褐色密茸毛。雌花瘦果倒卵圓形，管狀花瘦果倒卵狀楔形。花期6-9月，果期7-10月。