木瓜蛋白酶性狀：白色至淺棕黃色無定形粉末，有一定吸濕性，或為液體。溶于水和甘油，水溶液無色至淡黃色，有時呈乳白色，幾乎不溶于乙醇、氯仿和乙醚等有機溶劑。木瓜蛋白酶由木瓜制得的商品酶制劑中，含有如下三種酶：1.木瓜蛋白酶，分子量21000，約占可溶性蛋白質的10％；2.木瓜凝乳蛋白酶 ，分子量36000，約占可溶性蛋白質的45％；3.溶菌酶，分子量25000，約占可溶性蛋白質的20％。其主要作用是對蛋白質有極強的加水分解能力。適作用溫度為65℃，適作用PH值為5.0~7.0，在中性或偏堿性時亦有作用，耐熱性強，可在50~60℃時使用。90℃時不會完全失活。等電點pH8.75.

木瓜蛋白酶用途：酶制劑。木瓜蛋白酶主要用于啤酒抗寒（水解啤酒中的蛋白質，避免冷藏后引起的渾濁）、肉類軟化（水解雞肉蛋白和膠原蛋白，使肉類嫩化）、谷類預煮的準備、水解蛋白質的生產。在啤酒抗寒和肉類軟化方面的應用，遠比其他蛋白酶類廣泛。用量一般為1~4mg/kg.