中性蛋白酶已廣泛用于生產(chǎn)調(diào)味品和食品營養(yǎng)強化劑，各種動物來源性抽提物生產(chǎn)功能性骨、肉提取物（骨素）、水產(chǎn)提取物、蛋白胨、肽等及研究開發(fā)一些高附加值的功能食品。

● 焙烤行業(yè)的應(yīng)用：

中性蛋白酶可將面團的蛋白質(zhì)水解成胨、肽類甚至氨基酸，從而減弱面團筋力，使它具有良好的可塑性和延伸性，保持清晰美觀的印花圖案。改善成品的光澤、使餅干斷面層次分明，結(jié)構(gòu)均勻一致，口感松爽酥脆。

● 大豆分離蛋白的應(yīng)用：

能水解大豆分離蛋白成小分子肽，大大提高了大豆分離蛋白的生物效價，使其易為人體消化吸收，同時還提高了溶解，降低了粘度，改善了大豆分離蛋白的功能特性。

● 酵母抽提物、酵母浸膏的生產(chǎn)應(yīng)用

提高最終產(chǎn)品的蛋白質(zhì)利用率及風(fēng)味

● 啤酒工業(yè)：

添加中性蛋白酶分解蛋白質(zhì)為多肽和游離氨基氮，特別對大麥，大豆等植物性蛋白作用效果明顯，用于啤酒生產(chǎn)，可排除蛋白質(zhì)產(chǎn)生的"冷混濁"現(xiàn)象。

● 醫(yī)藥工業(yè)的應(yīng)用：

含中性蛋白酶的藥物，可起到消炎、利膽、止痛、助消化的功效。

● 紡織工業(yè)的應(yīng)用：

用中性蛋白酶處理過的羊毛，其抗張度比常規(guī)方法高，毛線手感柔軟，收縮性為0；還可用于蠶的脫膠和蠶絲的精煉。

● 皮革工業(yè)的應(yīng)用：

利用中性蛋白酶可制成脫毛劑，經(jīng)鞣制的皮革，脫毛干凈，粒而清晰，無明顯損傷，毛孔細(xì)致光亮。

● 飼料工業(yè)的應(yīng)用：

加入飼料配方中或直接與混合飼料混合飼喂，可提高蛋白質(zhì)的利用率和降低飼養(yǎng)成本。