菌根真菌在促進(jìn)植物根對(duì)有機(jī)污染物吸收的同時(shí)，也對(duì)根際圈內(nèi)大多數(shù)有機(jī)污染物尤其是持久性有機(jī)污染物(POPs)起到不同程度地降解和礦化作用，其降解的程度取決于真菌的種類、有機(jī)污染物類型、根際圈物理和化學(xué)環(huán)境條件及微生物群系間的相互作用。研究表明，許多外生菌根真菌對(duì)許朵POPs可以部分降解。腐生真菌及一些土壤動(dòng)物對(duì)污染物質(zhì)也有一定的修復(fù)作用。白腐真菌能產(chǎn)生一套氧化木質(zhì)素和腐殖酸的降解酶，這些酶包括木質(zhì)素過氧化物酶，錳過氧化物酶和漆酶，這些酶除能降解一些POPs外，其擴(kuò)散到環(huán)境介質(zhì)中的產(chǎn)物也能束縛一部分POPs，從而減輕對(duì)植物的度害。蚯蚓也能部分吸收重金屬，以減少對(duì)植物的度害。（3）有機(jī)污染物的轉(zhuǎn)化機(jī)制轉(zhuǎn)化或降解有機(jī)污染物是微生物正常的生命活動(dòng)或行為。這些物質(zhì)被攝入體內(nèi)后，微生物以其作為營養(yǎng)源加以代謝，一方面可被合成新的細(xì)胞物質(zhì)；另一方面也可被分解生成CO2和H2O等物質(zhì)，并獲得生長(zhǎng)所必需的能量。微生物通過催化產(chǎn)生能量的化學(xué)反應(yīng)獲取能量，這些反應(yīng)一般使化學(xué)鍵破壞，使污染物的電子向外遷移，這種化學(xué)反應(yīng)稱為氧化-還原反應(yīng)。其中，氧化作用是使電子從化合物向外遷移的過程，氧化-還原過程通常供給微生物生長(zhǎng)與繁衍的能量，氧化的結(jié)果導(dǎo)致氧原子的增加和氫原子的丟失；還原作用，則是電子向化合物遷移的過程，當(dāng)一種化合物被氧化時(shí)這種情況可發(fā)生。在反應(yīng)過程中有機(jī)污染物被氧化，是電子的丟失者或稱為電子給予體，獲得電子的化學(xué)品被還原，是電子的接受體。通常的電子接受體為氧、硝蒜鹽、硫酸鹽和鐵，是細(xì)胞生長(zhǎng)的最基本要素，通常被稱為基本基質(zhì)。這些化合物類似于供給人類生長(zhǎng)和繁衍必需的食物和氧。
植物修復(fù)：是生態(tài)修復(fù)的基本形式，在污染環(huán)境治理中，從形式上來看，似乎主要是植物在起作用，但實(shí)際上在植物修復(fù)過程中．往往是植物、根系分泌物、根際圈微生物、根際圈土壤物理和化學(xué)因素(這些因素可以部分人為調(diào)控)等在共同起作用?？偟膩砜?，植物修復(fù)幾乎包括了生態(tài)修復(fù)的所有機(jī)制，是生態(tài)修復(fù)的基本形式。生態(tài)修復(fù)的理論基礎(chǔ)編輯生態(tài)修復(fù)的對(duì)象是生態(tài)系統(tǒng)，因此，需要了解生態(tài)系統(tǒng)的一些基本屬性，如生態(tài)系統(tǒng)的結(jié)構(gòu)與功能、物理化學(xué)環(huán)境、生態(tài)系統(tǒng)中動(dòng)植物群落的演替規(guī)律，需要了解生態(tài)系統(tǒng)的優(yōu)勢(shì)物種或旗艦物種，還需要認(rèn)識(shí)生態(tài)穩(wěn)定性、生態(tài)可塑性以及生態(tài)系統(tǒng)的穩(wěn)態(tài)轉(zhuǎn)化等。只有這樣才能確定生態(tài)修復(fù)的目標(biāo)，才能制定有效的生態(tài)修復(fù)措施與技術(shù)組合。

生境  討論生境是指物種或物種群體賴以生存的生態(tài)環(huán)境。對(duì)藥用植物生存的一大威脅就是生境的破壞，如森林的砍伐、草原和濕地的開墾以及由此帶來水土流失、干旱化、養(yǎng)分的減少等。據(jù)報(bào)道，目前我國70%的天然林已被采伐，50%的草原被破壞，其中1/4 受到沙荒化威脅，大量的濕地面臨干涸。森林和草原是我國藥用植物物種生存的最豬要生境。由于生境的破壞，導(dǎo)致藥用植物物種局部絕，特別是導(dǎo)致野生資源量減少，不能滿足市場(chǎng)需求，從而進(jìn)一步加劇了資源過度利用的壓力，形成額性循環(huán)。 [1] 生境（habitat，Biotope 希臘語 bios = 生命 + topos = 地點(diǎn)）指生物的個(gè)體、種群或群落生活地域的環(huán)境，包括必需的生存條件和其他對(duì)生物起作用的生態(tài)因素。生境是指生態(tài)學(xué)中環(huán)境的概念，生境又稱棲息地。生境是由生物和非生物因子綜合形成的，而描述一個(gè)生物群落的生境時(shí)通常只包括非生物的環(huán)境。為了避免混亂，識(shí)別生境的這兩種用法是很重要的。